Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX56

Psmd8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd8Q9CX56 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd8Q9CX56 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms