Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX34

Sugt1, Protein SGT1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sugt1Q9CX34 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sugt1Q9CX34 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms