Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RpainQ9CWY9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RpainQ9CWY9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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