Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxxc1Q9CWW7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms