Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prkrip1Q9CWV6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prkrip1Q9CWV6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prkrip1Q9CWV6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prkrip1Q9CWV6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Prkrip1Q9CWV6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prkrip1Q9CWV6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prkrip1Q9CWV6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prkrip1Q9CWV6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prkrip1Q9CWV6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prkrip1Q9CWV6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prkrip1Q9CWV6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prkrip1Q9CWV6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms