Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Khdc3Q9CWU5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Khdc3Q9CWU5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms