Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

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Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Smurf1Q9CUN6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Smurf1Q9CUN6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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