Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930553M12RikQ9CUH1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930553M12RikQ9CUH1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms