Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Otud1Q9CUB6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otud1Q9CUB6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms