Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CRC3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CRC3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9CRC3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q9CRC3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Q9CRC3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CRC3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CRC3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CRC3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CRC3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CRC3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CRC3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9CRC3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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