Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA4

Msmo1, Methylsterol monooxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msmo1Q9CRA4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msmo1Q9CRA4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms