Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Atg12Q9CQY1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms