Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ykt6Q9CQW1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms