Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim8Q9CQQ0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim8Q9CQQ0 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms