Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrpb2Q9CQI7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Snrpb2Q9CQI7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms