Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE3

Mrps17, 28S ribosomal protein S17, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrps17Q9CQE3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrps17Q9CQE3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms