Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

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Length 51 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Rpl39lQ9CQD0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Rpl39lQ9CQD0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Rpl39lQ9CQD0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Rpl39lQ9CQD0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Rpl39lQ9CQD0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Rpl39lQ9CQD0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Rpl39lQ9CQD0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl39lQ9CQD0 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl39lQ9CQD0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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