Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC2

Clps, Colipase, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpsQ9CQC2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpsQ9CQC2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClpsQ9CQC2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms