Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ84

Ubl4b, Ubiquitin-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4bQ9CQ84 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ubl4bQ9CQ84 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ubl4bQ9CQ84 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ubl4bQ9CQ84 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ubl4bQ9CQ84 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ubl4bQ9CQ84 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ubl4bQ9CQ84 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ubl4bQ9CQ84 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ubl4bQ9CQ84 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ubl4bQ9CQ84 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ubl4bQ9CQ84 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ubl4bQ9CQ84 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ubl4bQ9CQ84 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ubl4bQ9CQ84 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ubl4bQ9CQ84 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ubl4bQ9CQ84 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ubl4bQ9CQ84 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ubl4bQ9CQ84 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms