Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pkp2Q9CQ73 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms