Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpa3Q9CQ71 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpa3Q9CQ71 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms