Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.3 ms