Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPU1

Ssxb1, MCG116417, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb1Q9CPU1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssxb1Q9CPU1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssxb1Q9CPU1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms