Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Scd3Q99PL7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms