Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup155Q99P88 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup155Q99P88 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup155Q99P88 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup155Q99P88 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup155Q99P88 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup155Q99P88 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup155Q99P88 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup155Q99P88 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup155Q99P88 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup155Q99P88 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup155Q99P88 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup155Q99P88 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup155Q99P88 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup155Q99P88 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup155Q99P88 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup155Q99P88 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nup155Q99P88 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup155Q99P88 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup155Q99P88 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup155Q99P88 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup155Q99P88 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup155Q99P88 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup155Q99P88 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup155Q99P88 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup155Q99P88 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup155Q99P88 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup155Q99P88 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup155Q99P88 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup155Q99P88 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup155Q99P88 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup155Q99P88 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup155Q99P88 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup155Q99P88 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup155Q99P88 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nup155Q99P88 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nup155Q99P88 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Nup155Q99P88 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nup155Q99P88 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Nup155Q99P88 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nup155Q99P88 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nup155Q99P88 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nup155Q99P88 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nup155Q99P88 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nup155Q99P88 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nup155Q99P88 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nup155Q99P88 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nup155Q99P88 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nup155Q99P88 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nup155Q99P88 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nup155Q99P88 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Nup155Q99P88 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nup155Q99P88 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
Nup155Q99P88 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Nup155Q99P88 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Nup155Q99P88 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Nup155Q99P88 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Nup155Q99P88 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nup155Q99P88 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nup155Q99P88 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nup155Q99P88 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nup155Q99P88 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nup155Q99P88 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nup155Q99P88 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nup155Q99P88 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nup155Q99P88 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nup155Q99P88 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nup155Q99P88 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nup155Q99P88 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nup155Q99P88 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup155Q99P88 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup155Q99P88 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup155Q99P88 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup155Q99P88 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup155Q99P88 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup155Q99P88 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup155Q99P88 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup155Q99P88 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup155Q99P88 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup155Q99P88 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup155Q99P88 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup155Q99P88 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup155Q99P88 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup155Q99P88 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup155Q99P88 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup155Q99P88 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup155Q99P88 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup155Q99P88 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup155Q99P88 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup155Q99P88 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup155Q99P88 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup155Q99P88 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup155Q99P88 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup155Q99P88 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup155Q99P88 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup155Q99P88 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup155Q99P88 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nup155Q99P88 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nup155Q99P88 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nup155Q99P88 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms