Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsnaxip1Q99P25 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms