Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH8

Trem2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem2Q99NH8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trem2Q99NH8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trem2Q99NH8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trem2Q99NH8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trem2Q99NH8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trem2Q99NH8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trem2Q99NH8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trem2Q99NH8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trem2Q99NH8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trem2Q99NH8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trem2Q99NH8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trem2Q99NH8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trem2Q99NH8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trem2Q99NH8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trem2Q99NH8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trem2Q99NH8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trem2Q99NH8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trem2Q99NH8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trem2Q99NH8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trem2Q99NH8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trem2Q99NH8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trem2Q99NH8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trem2Q99NH8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trem2Q99NH8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trem2Q99NH8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trem2Q99NH8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trem2Q99NH8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trem2Q99NH8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trem2Q99NH8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms