Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NsmfQ99NF2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms