Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Ubqln4Q99NB8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubqln4Q99NB8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Ubqln4Q99NB8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Ubqln4Q99NB8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubqln4Q99NB8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Ubqln4Q99NB8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Ubqln4Q99NB8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Ubqln4Q99NB8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubqln4Q99NB8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubqln4Q99NB8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubqln4Q99NB8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubqln4Q99NB8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubqln4Q99NB8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubqln4Q99NB8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubqln4Q99NB8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubqln4Q99NB8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ubqln4Q99NB8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ubqln4Q99NB8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ubqln4Q99NB8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ubqln4Q99NB8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ubqln4Q99NB8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ubqln4Q99NB8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ubqln4Q99NB8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ubqln4Q99NB8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ubqln4Q99NB8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms