Protein–RNA interactions for Protein: Q99N84

Mrps18b, 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrps18bQ99N84 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrps18bQ99N84 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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