Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hdac9Q99N13 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hdac9Q99N13 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms