Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramel1Q99MW3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramel1Q99MW3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramel1Q99MW3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramel1Q99MW3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramel1Q99MW3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramel1Q99MW3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramel1Q99MW3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramel1Q99MW3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramel1Q99MW3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramel1Q99MW3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramel1Q99MW3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramel1Q99MW3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramel1Q99MW3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pramel1Q99MW3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramel1Q99MW3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramel1Q99MW3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramel1Q99MW3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramel1Q99MW3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramel1Q99MW3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramel1Q99MW3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramel1Q99MW3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramel1Q99MW3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramel1Q99MW3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramel1Q99MW3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramel1Q99MW3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramel1Q99MW3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramel1Q99MW3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramel1Q99MW3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramel1Q99MW3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramel1Q99MW3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramel1Q99MW3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramel1Q99MW3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramel1Q99MW3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramel1Q99MW3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramel1Q99MW3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramel1Q99MW3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pramel1Q99MW3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramel1Q99MW3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramel1Q99MW3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramel1Q99MW3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramel1Q99MW3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramel1Q99MW3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramel1Q99MW3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramel1Q99MW3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramel1Q99MW3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramel1Q99MW3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramel1Q99MW3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramel1Q99MW3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramel1Q99MW3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramel1Q99MW3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramel1Q99MW3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramel1Q99MW3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramel1Q99MW3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramel1Q99MW3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramel1Q99MW3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramel1Q99MW3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramel1Q99MW3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramel1Q99MW3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pramel1Q99MW3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pramel1Q99MW3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Pramel1Q99MW3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramel1Q99MW3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramel1Q99MW3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramel1Q99MW3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramel1Q99MW3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramel1Q99MW3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramel1Q99MW3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramel1Q99MW3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramel1Q99MW3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramel1Q99MW3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramel1Q99MW3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramel1Q99MW3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramel1Q99MW3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramel1Q99MW3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramel1Q99MW3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramel1Q99MW3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramel1Q99MW3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramel1Q99MW3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pramel1Q99MW3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramel1Q99MW3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramel1Q99MW3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramel1Q99MW3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramel1Q99MW3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramel1Q99MW3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramel1Q99MW3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramel1Q99MW3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramel1Q99MW3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramel1Q99MW3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramel1Q99MW3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramel1Q99MW3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramel1Q99MW3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramel1Q99MW3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramel1Q99MW3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramel1Q99MW3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramel1Q99MW3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramel1Q99MW3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramel1Q99MW3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramel1Q99MW3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramel1Q99MW3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms