Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp1b4Q99ME6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp1b4Q99ME6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms