Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PtprtQ99M80 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprtQ99M80 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms