Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gins4Q99LZ3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms