Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gdpd3Q99LY2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gdpd3Q99LY2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms