Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Chmp1b1Q99LU0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chmp1b1Q99LU0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms