Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cstf3Q99LI7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms