Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nmd3Q99L48 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms