Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms