Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ciao1Q99KN2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ciao1Q99KN2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ciao1Q99KN2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ciao1Q99KN2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ciao1Q99KN2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ciao1Q99KN2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ciao1Q99KN2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ciao1Q99KN2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ciao1Q99KN2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ciao1Q99KN2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ciao1Q99KN2 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ciao1Q99KN2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ciao1Q99KN2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ciao1Q99KN2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ciao1Q99KN2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ciao1Q99KN2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ciao1Q99KN2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ciao1Q99KN2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ciao1Q99KN2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ciao1Q99KN2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ciao1Q99KN2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ciao1Q99KN2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ciao1Q99KN2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ciao1Q99KN2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ciao1Q99KN2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ciao1Q99KN2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ciao1Q99KN2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ciao1Q99KN2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ciao1Q99KN2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ciao1Q99KN2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ciao1Q99KN2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ciao1Q99KN2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ciao1Q99KN2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ciao1Q99KN2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ciao1Q99KN2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ciao1Q99KN2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ciao1Q99KN2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ciao1Q99KN2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ciao1Q99KN2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ciao1Q99KN2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ciao1Q99KN2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ciao1Q99KN2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ciao1Q99KN2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ciao1Q99KN2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ciao1Q99KN2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ciao1Q99KN2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ciao1Q99KN2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ciao1Q99KN2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ciao1Q99KN2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ciao1Q99KN2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ciao1Q99KN2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ciao1Q99KN2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ciao1Q99KN2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ciao1Q99KN2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ciao1Q99KN2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ciao1Q99KN2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ciao1Q99KN2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ciao1Q99KN2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ciao1Q99KN2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ciao1Q99KN2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms