Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab28Q99KL7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab28Q99KL7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms