Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp11Q99K46 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms