Protein–RNA interactions for Protein: Q99JX1

Taf11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf11Q99JX1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Taf11Q99JX1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms