Protein–RNA interactions for Protein: Q99JH8

Kdelr1, ER lumen protein-retaining receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdelr1Q99JH8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kdelr1Q99JH8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kdelr1Q99JH8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kdelr1Q99JH8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kdelr1Q99JH8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kdelr1Q99JH8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kdelr1Q99JH8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kdelr1Q99JH8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kdelr1Q99JH8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kdelr1Q99JH8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Kdelr1Q99JH8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kdelr1Q99JH8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kdelr1Q99JH8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kdelr1Q99JH8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kdelr1Q99JH8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kdelr1Q99JH8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kdelr1Q99JH8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kdelr1Q99JH8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kdelr1Q99JH8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kdelr1Q99JH8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kdelr1Q99JH8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kdelr1Q99JH8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kdelr1Q99JH8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kdelr1Q99JH8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Kdelr1Q99JH8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Kdelr1Q99JH8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kdelr1Q99JH8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms