Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
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Ctu1Q99J10 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Ctu1Q99J10 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Ctu1Q99J10 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Ctu1Q99J10 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctu1Q99J10 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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