Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn16Q925N4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms