Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csmd1Q923L3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csmd1Q923L3 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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