Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spdl1Q923A2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Spdl1Q923A2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Spdl1Q923A2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Spdl1Q923A2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Spdl1Q923A2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spdl1Q923A2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spdl1Q923A2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spdl1Q923A2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spdl1Q923A2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spdl1Q923A2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spdl1Q923A2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spdl1Q923A2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spdl1Q923A2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spdl1Q923A2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spdl1Q923A2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spdl1Q923A2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spdl1Q923A2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spdl1Q923A2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spdl1Q923A2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spdl1Q923A2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spdl1Q923A2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spdl1Q923A2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spdl1Q923A2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms