Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prpf3Q922U1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms